万方查重系统支持的文件格式非常丰富，包括doc、docx、pdf、txt、ppt等常见的办公文档格式，同时也支持rar、zip等压缩文件格式。此外，对于html、xml等网页文件格式也能够进行查重处理。用户可以放心使用万方查重系统来检测各种常见的文件格式，确保文档的原创性。

除了常见的文档格式，万方查重系统还支持一些特殊的文件格式，比如cad、psd等专业设计软件生成的文件格式，以及一些程序代码文件格式如java、c等。这些特殊格式的支持，使得万方查重系统更加全面，能够满足用户的各种查重需求。