万方查重系统通过比对用户提交的论文与其数据库中的文献，利用先进的文本比对算法，检测论文中的相似度。系统会分析文本相似度高的部分，提供相似度报告，并标注可能存在的学术不端行为，如抄袭、剽窃等。同时，系统还会结合文献引用、语义分析等多种技术手段，提高识别学术不端行为的准确性。

万方查重系统识别学术不端行为的原理主要是依靠先进的文本比对算法和多种技术手段的综合应用。系统会对用户提交的论文进行全文比对，分析文本相似度高的部分，并标注可能存在的学术不端行为。除此之外，系统还会结合文献引用、语义分析等多种技术手段，提高识别学术不端行为的准确性。